ตามที่มีข่าวว่ามีรัฐควีนแลนด์ประเทศออสเตรเลียห้ามนำเข้ากุ้งจากทุกประเทศทั่วโลกรวมทั้งไทยนั้น มกอช. ได้ตรวจสอบข้อเท็จจริงแล้วพบว่า จนถึงขณะนี้ยังไม่มีการห้ามนำเข้าแต่อย่างไร
เมื่อวันที่ 23 พฤศจิกายน 2549 ออสเตรเลียได้ออกร่างประเมินความเสี่ยงกุ้งและผลิตภัณฑ์กุ้ง รวมทั้งกำหนดเงื่อนไขในการจัดการความเสี่ยงต่างๆ และได้แจ้งเวียนให้ประเทศต่างๆพิจารณาให้ข้อคิดเห็นใน 90 วัน ซึ่งจะสิ้นสุดระยะเวลาในการให้ความเห็นในวันที่ 21 กุมภาพันธุ์ 2550 ซึ่งขณะนี้ฝ่ายไทยอยู่ระหว่างการพิจารณาให้ข้อคิดเห็น โดย มกอช. ร่วมกับกรมประมงได้เตรียมนำเรื่องนี้เจรจากับออสเตรเลียในการประชุมคณะทำงานผู้เชี่ยวชาญด้านสุขอนามัยและสุขอนามัยพืชและมาตรฐานอาหารไทย-ออสเตรเลีย ระหว่างวันที่ 13-14 ธันวาคม 2549 นี้
ไทยส่งออกกุ้งไปออสเตรเลียปี 2547 จำนวน 8,604 ตัน มูลค่า 2,075 ล้านบาท ปี 2548 จำนวน 10,421 ตัน มูลค่า 2,401 ล้านบาท และ 10 เดือนแรกของปี 2549 จำนวน 16,233 ตัน มูลค่า 1,883 ล้านบาท
อนึ่ง ในเดือนมิถุนายน 2549 เคยปรากฎข่าวและบทความในรัฐควีนส์แลนด์ ออสเตรเลียต่อต้านกุ้งนำเข้าจากประเทศต่างๆในเอเชีย และเรียกร้องให้ทางการออสเตรเลียสั่งห้ามนำเข้ากุ้งจากต่างประเทศ โดยอ้างถึงข้อมูลการตรวจสอบกุ้งดิบนำเข้าของหน่วยงาน AQIS ว่าพบเชื้อไวรัส White Spot Sysdrome Virus (WWSV), Taura Syndrome Virus (TSV) และ Yellowhead Virus (YHV) เชื้อไวรัสดังกล่าวไม่เป็นอันตรายต่อสุขภาพของมนุษย์และจะตายด้วยการต้มให้สุก แต่ประเด็นที่อุตสาหกรรมกุ้งออสเตรเลียอ้างถึง คือ การใช้กุ้งนำเข้าเป็นเหยื่อตกปลา ทำให้เชื้อโรคมีโอกาสแพร่ลงสู่แหล่งน้ำ
มกอช.