สำนักงานที่ปรึกษาการเกษตรต่างประเทศ (สปษ.) ประจำกรุงจาการ์ตา อินโดนีเซีย รายงานเมื่อวันที่ 17 พฤษภาคม 2555 ว่า กระทรวงเกษตรอินโดนีเซียเตรียมบังคับใช้กฎกระทรวง 89/2011 และ 90/2011 ในวันที่ 19 มิถุนายน 2555 ซึ่งจะมีผลจำกัดจุดนำเข้า สินค้าเกษตรจาก 8 จุด เหลือเพียง 4 จุด ได้แก่ ท่าเรือ Belawan เมือง Medan, ท่าเรือ Makassar เมือง Makassar, ท่าเรือ Tanjung Perak เมือง Surabaya และท่าอากาศยาน Soekarno-Hatta กรุงจาการ์ตา ส่วนท่าเรือ Tanjung Priok กรุงจาการ์ตา จะอนุญาตให้นำเข้าเฉพาะสินค้าจากประเทศที่ผ่านการรับรองระบบการผลิตสินค้าเกษตรตามมาตรฐานสากล (Mutual Recognition Agreement - MRA)
สปษ. จาการ์ตา ประเมินว่า พืช ผัก ผลไม้ ของไทยที่จะได้รับผลกระทบในการส่งออกประกอบด้วย หอมแดง พริก หอมหัวใหญ่ กระเทียม มะม่วงน้ำดอกไม้ มะม่วงเขียวเสวย มะม่วงมหาชนก มะม่วงโชคอนันต์ ส้มเขียวหวาน เงาะ มะพร้าวน้ำหอม มะพร้าวเผา ลิ้นจี่ สับปะรด ส้มโอ มะละกอ และมังคุด ที่จะนำเข้าสู่อินโดนีเซียได้เพียง 4 จุดนำเข้าตามกฎกระทรวงดังกล่าว
อนึ่ง ทางการอินโดนีเซียได้ประสานงานเพื่อชี้แจงต่อองค์การการค้าโลก (WTO) ว่านโยบายดังกล่าวไม่ใช่การปฏิบัติที่ไม่เท่าเทียมกัน เนื่องจากการอนุญาตนำเข้าเฉพาะประเทศที่ได้รับ MRA มีวัตถุประสงค์หลักคือการควบคุมโรคและศัตรูพืชปนเปื้อน รวมทั้งลดปริมาณการขนส่งสินค้าหนาแน่นคับคั่งที่ทำให้การตรวจสอบไม่มีประสิทธิภาพเพียงพออีกด้วย ซึ่งถือเป็นการคุ้มครองสุขอนามัยและความปลอดภัยของผู้บริโภคในประเทศ โดยประเทศที่ผ่านการรับรองในปัจจุบัน ได้แก่ สหรัฐอเมริกา แคนาดา และออสเตรเลีย จะได้รับการยกเว้นไม่ต้องตรวจสอบสินค้าในแต่ละ Consignment ไปจนถึงขั้นตอนการตรวจสอบทางห้องปฏิบัติการ นอกจากนี้ ทางการอินโดนีเซียกำลังพิจารณารับรองระบบการผลิตของประเทศนิวซีแลนด์เพิ่มเติมด้วย
